Administrar los recursos financieros del Instituto en cumplimiento de la normatividad aplicable vigente a través de la implementación de políticas institucionales que permita su manejo, a fin de generar información contable y presupuestal, proporcionando elementos para la toma de decisiones de las autoridades institucionales.
Ser una Subdirección de referencia para otras instituciones de salud, por el manejo de los recursos financieros y la calidad de la información que proporciona para la toma de decisiones con vocación de servicio, ética y compromiso social de las servidoras y los servidores públicos que la integran.